逾期不提出的协议是否有效，视为员工确认公司已全额支付报酬？如加班费？

逾期不提出异议的协议无效。依据《劳动法》，工资应按月支付，不定时支付违法。若不及时处理，可能导致劳动者权益受损，无法追回应得报酬。
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协议无效。处理方式：1.与公司协商，要求支付应得报酬；2.若协商无果，向劳动监察举报投诉，并提供相关证据；3.如问题仍未解决，可申请劳动仲裁，必要时提起诉讼，维护自身权益。
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常见处理方式是协商、投诉或诉讼。应先尝试与公司协商，协商无果可向劳动监察大队投诉，或提起劳动仲裁甚至诉讼。